Đáng chú ý, trong thông báo kết luận được cơ quan thanh tra chỉ ra có đến 7 vụ việc sai phạm nghiêm trọng nên chuyển sang Cơ quan điều tra Bộ Công an tiếp tục xác minh làm rõ dấu hiệu sai phạm hình sự, gồm: Việc cấp phép nhập khẩu trang thiết bị y tế trái quy định có dấu hiệu lợi ích nhóm ở Vụ Trang thiết bị và công trình y tế tại Bộ Y tế; hồ sơ về hai gói thầu đấu thầu tập trung năm 2017 tại Trung tâm Mua sắm tập trung quốc gia liên quan đến Liên danh Công ty UNI - Văn Lang; hồ sơ việc thực hiện liên doanh, liên kết đối với 11 máy liên doanh, liên kết, máy đặt tại Bệnh viện Bạch Mai; thông tin việc mua sắm robot hỗ trợ phẫu thuật sọ não tại Ban Quản lý dự án đầu tư xây dựng công trình văn hóa - xã hội thành phố Hà Nội; thông tin việc mua sắm thiết bị, vật tư y tế liên quan hơn mười gói thầu năm 2018, 2019 tại Bệnh viện Tim Hà Nội; việc thực hiện gói thầu "Cung cấp và lắp đặt hệ thống xạ trị…" của Bệnh viện Ung bướu Thành phố Hồ Chí Minh; việc đấu thầu mua sắm thiết bị đối với 2 gói thầu cung cấp lắp đặt thiết bị xạ trị tại Bệnh viện K.

Ngoài 7 vụ việc trên, Thanh tra Chính phủ cho rằng việc liên kết thiết bị phục vụ khám chữa bệnh tại các bệnh viện còn nhiều sai phạm như sử dụng nhà, tài sản để góp vốn nhưng không có phê duyệt của Bộ trưởng Y tế; không xác định giá trị đất đai, nhà cửa theo giá trị trường khi góp vốn.

Việc xác định chi phí khấu hao cũng chưa đúng quy định; giá dịch vụ khám bệnh bằng thiết bị liên doanh còn cao hơn giá dịch vụ Bảo hiểm Y tế hoặc không kê khai giá theo quy định. Thanh tra Chính phủ đề nghị Bộ Y tế chỉ đạo các bệnh viện hủy hoặc điều chỉnh các hợp đồng liên doanh như trên, xác định lại giá khám chữa nhằm tránh gây ảnh hưởng tới bệnh nhân.