Nội dung chương trình phối hợp giữa hai Học viện tập trung vào việc hợp tác trong xây dựng chương trình đào tạo, bồi dưỡng và quy định về chuẩn đầu ra; Trao đổi kinh nghiệm trong tổ chức thực hiện chương trình, kế hoạch đào tạo, bồi dưỡng; Phối hợp đào tạo, nâng cao trình độ chính trị, pháp luật, nghiệp vụ an ninh và nghiệp vụ sư phạm cho cán bộ, giảng viên, học viên của hai Học viện; Phối hợp xây dựng và triển khai các chương trình, đề tài nghiên cứu khoa học về bảo vệ an ninh quốc gia, đảm bảo trật tự, an toàn xã hội, xây dựng Đảng, xây dựng lực lượng Công an nhân dân; Hợp tác trao đổi kinh nghiệm trong quản lý, giáo dục học viên các hệ đào tạo tập trung tại trường và hệ vừa làm vừa học tại các địa phương.
Để chương trình phối hợp đạt hiệu quả cao, lãnh đạo hai Học viện đều khẳng định sẽ thực hiện nghiêm túc các nội dung đã được xác định, đảm bảo đúng phạm vi, nguyên tắc, chức năng, nhiệm vụ của từng Học viện, tăng cường mối quan hệ đoàn kết, gắn bó chặt chẽ, giúp đỡ nhau cùng phát triển và hoàn thành tốt nhiệm vụ được giao.